MKVToolnix, daha çok MKV olarak bilinen Matroska biçimindeki videoları düzenlemek ve dönüştürmek için kullanılan bir uygulamadır. Bu video formatı, aynı dosya içinde çok sayıda dilde çok sayıda ses ve alt yazı içerebildiğinden, filmler ve diziler için en yaygın kullanılan biçimdir.